康健基因科技藉助抗疫專案解密COVID-19之基因突變

康健是結合生物實驗與資訊科技的公司，成立至今邁入第十年，主要目標是發展人類健康相關的檢測產品，截至目前已有「疾病風險評估」、「腸道菌相檢測」等成果；此外因康健擁有生物實驗室、運算分析團隊，亦會承接學研機構委託的生物實驗暨資料分析專案。

2020年在COVID-19(新冠肺炎)病毒基因定序需求下，康健也極力發展更多疫情相關分析工具，供研究單位使用。康健基因科技副執行長王威霽表示，2019年7月起，康健基因科技亟需找尋GPU運算服務，以滿足Oxford Nanopore第三代定序儀大量訊號轉換的需求，而找上國網中心，現在因應疫情研究需求，更借重國網AI運算平台加速執行Oxford Nanopore第三代定序儀MinION的訊號轉換，以及後續資料分析工作，以發展更多低成本的分析工具、提供研究單位使用。

電訊號轉成DNA訊號，須靠龐大運算力支撐

王威霽說，2017 年Oxford Nanopore的MinION正式商業化，由於此定序儀狀似USB輕巧易攜帶，加上價格僅約新台幣3萬元，遂吸引許多研究人員採用。深究Nanopore運作原理，乃是利用電流刺激奈米孔洞，假使孔洞空間被DNA分子佔據，便形成電壓阻塞，可藉由此變化來推算DNA訊號；但欲將電訊號轉為生醫專家可識別的文字，需歷經繁重的AI運算。

有研究單位規劃以Nanopore分析 COVID-19病毒株，發現單憑一般電腦無法執行訊號轉換，於是委託康健予以協助。康健認為此專案深具意義，願意提供奧援，但考量背後計算需求過大，並非內部資源所能負荷，原本想利用公有雲服務填補需求缺口，無奈要價不菲難以如願，在因緣際會之下接觸到TWCC臺灣AI雲，發現其堪稱臺灣最大GPU農場，資源豐富不在話下，且收費相當合理，以致康健確定採納該平台，展開COVID-19病毒基因定序作業。

「我們利用國網AI雲平台從事兩階段工作，首先執行Nanopore訊號轉換，藉此得知COVID-19病毒每段RNA序列的樣貌，」王威霽說，第二階段則是執行資料分析，旨在找出COVID-19基因突變。而康健在執行過程中獲得諸多啟發，認為不少研究人員或老師投入研究計畫時，能夠運用的經費有限，往往難以籌措足夠的人、機器、實驗室等資源；因此康健有意與國網中心攜手共創高CP值分析工具，讓臺灣的生醫研發腳步走得更快。

經由強強聯手，打造高性價比分析工具

透過多次交流，康健理解到國網AI雲平台TWCC不僅提供運算資源，也亟可能發展成為臺灣的AI Marketplace，如果以大家熟悉的蘋果iOS平台比喻，即是希望建立豐富App，滿足各個領域的應用需求；是以康健有想要於上發展生物檢測方面的服務模型，自此雙方締結夥伴關係。

王威霽表示，康健規劃於TWCC平台上架設一個Web UI，提供予研究人員或老師上傳Nanopore的測試資料，接著在5~10分鐘過後，就能取得反饋、獲致訊號轉換結果，更有效率地推動下一步的分析工作，有助於加速產出最終開發成果。他預期此項服務一旦推出，將對臺灣生物實驗領域產生正面影響，後續效應相當值得期待。

總而言之，伴隨生物實驗儀器日益精進，所產出的資料筆數與數量就愈來愈大，導致研究者必須仰賴強大算力，才足以快速剖析出箇中玄機；為此康健將偕同TWCC形成堅實後盾，幫助研究者無後顧之憂推動實驗工作，造福人類健康。